随着测序技术的进步,低价的DNA测序服务相继涌现,深深的改变了基因组学研究进程。自1990年开始的人类基因组计划启动,直至2003年获得全基因组序列宣告计划结束,整个人类基因组测序花费30亿美元。相对于如今技术,同样的基因组测序,花费只需1000美金, 测序费用的大大降低,有赖于新技术工具的发展。下一代测序技术,为大规模高通量的核酸序列测试铺平了道路。Solexa, 454 以及 SOLiD这些测序平台为获取基因组信息提供了独特的方法,各有所长,适用于不同类型的测序项目。随着现有测序技术持续改进,新的下一代测序方法也相继出现,例如Ion Torrent 以及Pacific Biosystems,为未来更低花费的基因组研究提供可能,满足各种不同的用户需要。
下一代测序把基因组研究变得更容易,但就其测序本身,只是整个庞大工作的其中一个流程,只有把测序前的准备工作做好,才能真正从下一代测序的便利中获得实惠。测序能力的提升,意味着对于样品收集、核酸纯化、文库制备以及序列分析等工作也提出了更高要求。传统的手动操作步骤,以及成本、通量及结果变异性的诸多挑战,掣肘了NGS的高效率发挥。而且传统的样品制备和数据分析方法耗时容易出错。
欧罗拉,实验室自动化领导者,针对NGS工作流程中的挑战,提供了与之相关多个配套自动化方案选择,把传统手动的操作实现自动化,减少样品间变异并提供了最终数据的精确度。
VERSA工作平台上典型的NGS文库制备流程
VERSA Gene 1100适用于基因组学研究的全部自动化流程需要,完全无人值守,节省人力与时间成本。8通道移液头轻松应对NGS的高通量需求,兼具单通道液体处理功能,灵活应对文库标准化和样品混合等步骤。Aurora公司为进一步提高NGS文库制备自动化流程效率,特别研发专利技术,如磁珠混合器、升降磁盘以及96孔真空吸废器,降低文库制备耗时,同时提高样品回收率和结果精确度。
相对高通量平台,VERSA Gene 10紧凑小巧,性价比高。虽然不及VERSA Gene 1100功能强大,但是仍然支持各种基因组学研究流程,包括PCR体系构建、酶反应体系、样品混合以及部分NGS文库制备工作流程。而且可以根据用户处理通量需求进行扩展,同时处理1到96个样品。
VERSA Gene 1100
VERSA Gene 10
表1: 扩增纯化的NGS文库浓度, 包括手动以及自动化的阴阳对照样品, 文库浓度都在可接受的质量控制(QC)范围内
表2:手动和自动化制备的文库测序结果的线性相关关系
通过表1数据显示,手动以及自动化制备的阴性和阳性对照样品的扩增纯化NGS文库浓度,都在可接受的质量控制范围内。而且,通过表2可知,手动和自动化制备的文库,测序结果线性相关系数r2相当接近1,无论是阳性还是阴性对照样品,结果是一致的。VERSA Gene的磁珠混合器以及自动液体处理模块,实现了磁珠均匀悬浮以及精确分装,从而保证了最后测序结果的质量以及重现性。
欧罗拉公司专业的技术服务团队与用户紧密合作,努力为用户挑选出在满足其需求的最佳方案。此外,VERSA系列液体处理工作站提供多种功能模块与适配器部件,强大而灵活,允许用户根据实验方案需求自由配置,真正实现自动化流程。更多的实验解决方案,请联系欧罗拉的技术支持团队