文库制备就是NGS流程中重要的第一步。以往这是一个步骤繁多的过程,费时又费力。而文库制备自动化的应用,让这一过程很大改进。从手动制备转换到自动制备,这里面的好处很多。
自动化文库制备具备很多优点:快速、高效,不容易发生人为错误,不容易受到污染,结果一致性高。
在自动化仪器的选择上,Aurora的移液工作站具备开放行,可整合第三方耗材、仪器和试剂盒。对比其他封闭平台表面价格高但后期封闭的耗材贵,Aurora后期成本更低。
在自动化方案的样品数量上。需要考虑实验需要一次处理多少个样品。Aurora移液工作站根据用户应用需求,推荐8通道至96通道,甚至更多,兼容单通道,让高中低通量的实验室都能用上自动化仪器。全自动的流程是无人值守系统,可让研究员化更多精力花在分析数据上。
仪器推荐
欧罗拉的VERSA GENE是一个可兼容多种试剂盒和实验耗材的开放性系统。其灵活的可扩展性设计可轻松应对NGS文库制备流程中对不同通量,实验时间和预算的要求。欧罗拉独特的创新模块,能够解决测序文库制备过程中遇到的多种难题,确保NGS制备流程中对高通量和实验重复性、精确度的要求。
应用流程
磁珠混合器——创新技术
创新性的磁珠混合器,在分配到目标孔位前能保持磁珠振荡混匀,确保磁珠均匀悬浮不沉降。并且最大限度减少了闭死容积,减少磁珠损耗。手动吸喷混匀磁珠,经常容易导致磁珠聚集,而且附着在枪头内壁,导致磁珠浪费、混匀效果不如意、吸附效率低。若磁珠沉降较快,也限制了磁珠分配时间。磁珠混合器正好弥补了这些缺陷,具有不可比拟的优势。
在分配至孔板前前,磁珠混合器能很好的保持悬浮混匀,溶液呈现均一状态
减少了磁珠损耗,保证产出率
底部磁珠重悬非常重要,直接影响基因产量、浓度、一致性以及文库质量
每次使用前都重悬磁珠,保证分配时候均一
– Illumina ™ NGS Sample Preparation Protocol
应用领域
- DNA/RNA产物纯化
- DNA/RNA片段大小筛选
- 酶反应体系构建
- 文库标准化和混合
- 单一/多重RT-PCR体系构建
- 测序反应体系构建
- Oligo合成体系构建
- 磁珠纯化应用